画质粒图（snapgene画质粒图谱）

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第一步，看箭头：大多数质粒都会有箭头，箭头有两种解释。一种是转录方向，转录方向主要是由启动子开始的一个大箭头，是启动子启动序列的顺序。

上面质粒图谱中圈出的AmpR，NeoR/KanR等表示质粒中抗性筛选标签，方便后面筛选出阳性克隆(重组成功的阳性质粒；自连的假阳性质粒需要后续质粒测序验证)。

质粒中有两个 origin 的，为穿梭质粒，既可以在原核细胞复制，也可在真核细胞中复制。筛选标记：多为抗性基因，以便加以检测筛选；只存在单抗性的质粒多为原核克隆载体和原核表达载体。

这是用来区分克隆载体与表达载体的。克隆载体中加入一些表达系统元件即成为表达载体。对于质粒发挥作用，至关重要！启动子：是RNA聚合酶结合位点，位于基因表达框的上游。

Kan（卡那霉素，常用）、Cmr（氯霉素，某些酵母表达质粒）、SM（链霉素）、多克隆位点 MCS：它具有多个限制酶的单一切点。便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入，会导致某种标志基因的失活，而便于筛选。

克隆质粒载体：一般是高拷贝的就是上面讲的松弛型质粒，将需要的目的基因插入到质粒后倒入到细菌中，进行大量克隆扩增目的片段。

植物基因组DNA在琼脂糖电泳图上观察到的线条一般后头有弥散带，因为在提取DNA时会有染色体断裂的现象。

质粒DNA电泳的三条带质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA，是进行DNA重组的常用载体。作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外，质粒DNA上携带了部分的基因信息，经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。

正常质粒是闭合的双链DNA。在电泳过程中可能使质粒发生开环，或者由开环解开螺旋变成线形。这三种形态电泳时的分离率不同，分离速度不同，分成三带。闭环（超螺旋），开环，线形的螺旋率依次降低。

胶浓度应该再小一点，3 跑得时间太短，4 加些DNAse free RNAse。再说DNA电泳图。如果胶浓度和电泳时间都与质粒电泳差不多，那么最上面和最下面的两条带也就分别是加样孔和RNA。靠近加样孔隐约的那条带可能是你的DNA。

1、这里对多重序列比对格式（Multiple sequence alignment – MSA）进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等，都需要涉及到多重序列比对。

2、这里对多重序列比对格式(Multiple sequence alignment – MSA)进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等，都需要涉及到多重序列比对。

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